水环境保护依靠水环境质量监测，但是监测必须依靠定时地点采样方可满足污染控制需求。但是，传统检测技术主要是依靠大量数据来研究水环境质量变化趋势，这一手段严重浪费人力物力资源，而且瞬时数据并不具有可靠性。因此，自动检测技术能有效消除上述缺陷，通过连续性数据反映水环境每一时刻的状态，从而便于工作人员制定决策。
水质自动监测技术在水环境保护中的作用
数据准确性更高
由于传统水质检测技术无法实时反映水环境质量状况，导致工作人员无法及时对水环境质量做出判断并提出建议，更会导致管理和治理方针无法立刻落实。如今，水质自动监测技术连续反映水环境质量，不仅相较过去具有更高的准确性，结合多项先进技术，可针对水质五参数、化学需氧量、高锰酸盐指数、氨氮、叶绿素乃至部分重金属等多种指标实施监测，且各类数据可自动归类并通过有线或者无限等途径上传至数据库，最终落入监测中心工作人员手中，检测频次效率更高，减轻工作人员劳动量。
避免人为误差
由于水环境监测以及治理内容较为繁琐，包括水样采集、水样检验、数据整理等，导致各项资源无止境支出，但是自动监测技术无需人力物力，通过计算机全自动运行计算，降低大量的经济成本，而且由于工作人员数量稀缺，且从在职业素养、个人能力等多方面因素，可能导致人为误差产生，降低监测准确性。
降低了水质监测的管理成本
虽然水质自动监测仪器经济成本较高，但是相对比传统监测技术，其整体经济成本略低，有效减轻政府以及企业压力。此外，水质自动监测仪器省去人工成本，换言之，降低管理成本，管理人员不必全天候监督工作人员完成任务，只需定时要求其发送报告即可。
水质自动监测技术的应用
地表水监测
通过水质自动监测仪器检测地表水质时，工作人员可打破空间束缚，远程控制并实施监测水资源状况，同时，可针对地面以及流域水质展开监测，如果探查到水质状况受到污染，则应当立即上报相关部门加以整治，不仅加快治理水污染效率，而且减少由于水污染而产生的各类纠纷事件。目前，各种地表水监测均增加对水质自动监测技术的使用频率，国内大型湖泊以及水环境均覆盖自动监测设备，有效掌握地表水总量信息，也已取得巨大收益。
水库中的应用
目前，水质自动监测技术可探查水质内数十种指标，不仅强化治理措施，而且避免细微元素对水质产生危害而造成严重损失，传统监测技术可能探查不到多种元素，等发现时已难以整治。尤其是大型水源地，只要实时探查水质，保证人民群众得到干净饮用水，便实现预期目标。此外，水质数据还可以完成水质实时数据的监测、传输、自动控制，对水质的信息可以随时查询，一旦被监测水源地的水质超出规定标准，那么自动监测系统会自动报警。并且及时实施应急措施，进而保证水质的安全性，确保人们的饮水安全。
排污口污水水质监测
由于治理污水排放时，政府机构会遭遇大量问题：首先，由于此领域的工作人员数量稀缺，因此无法保证实时检查，导致部分企业投机取巧，依然实施违法行为。其次，部分企业未能及时上交排污费，甚至故意不缴费，从而导致政府无法及时治理。而上述问题便可通过自动监测污水口流量以及水质指标来解决。
